卓一航没有死，练霓裳被卓一航重伤后一夜白头，离开了卓一航。随后，卓一航辞去掌门之位去追练霓裳，但是在山上隐居的练霓裳根本不见他，卓一航便在山下定居。
大结局：练霓裳走后，卓一航如疯似狂，形同 。一日突被人点醒，心中的忧郁犹如火山喷发，他终于不顾一切地冲下武当山，追寻练霓裳的踪迹。一番辛苦，直至晦明禅师隐居的天山北高峰，他终于得知了练隐居于天山南高峰，即冒雪前往寻访。
然练已心灰意冷，不肯谅解和好。卓一航失望而归，自此在天山南北、草原沙漠中漫 侠，收下徒弟辛龙子。从辛龙子口中，卓一航终寻得传说中能使白发变黑的「优昙仙花」，却因该花已开过，尚需六十年的守候，卓决意守候至仙花开放之日。
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到了卓一航十九岁这年， 道长见他武功已成，而卓继贤又想他回京应举，因此 道长送他回来，并赐了他一把寒光剑。分手时 道长道：「我深愿你在宦海中不要沉迷，将来武当派掌门的担子，还要你肩担呢。」卓一航领了师父的吩咐，回转家门，三年不见，他已长得比父亲还高一个头了。
父子团圆，一家高兴。却不料风波忽起，横祸飞来，父子相聚，不到三月，卓继贤就被卷入了「梃击案」的漩涡，一日上朝，遂成永诀。卓一航哀 逾常，在居官的父执处探听得知，父亲乃是被郑国舅所诬陷，而郑国舅又是秉承他妹子郑贵妃的意旨。卓一航一怒之下，不管宫中好手如云，竟自一剑单身，深宵闯入。
参考资料来源：百度百科-白发魔女传
他们两个最后也没在一起，后来卓一航死了，留给了白发魔女一封遗书，他们两真正的结局在七剑下天山里。
白发魔女悠然遇思，茫然若梦，七十年前旧事，都上心头。
七十年前，白发魔女还只是二十多岁的少女，可是却已名震江湖，是西北的剧盗；卓一航则是个贵家公子，他的祖父是个卸任总督，告老还乡时曾被白发魔女拦途截劫，并伤了卓一航的一位同门。也是合当有此“情孽”，后来他们竟因“不打不成相识”，而至彼此倾心。可是卓一航到底是显贵之后，爱意只是存在心中，不敢表露，更不肯入伙做强盗，白发魔女一怒而去，再过几年，卓一航已经成为武当派的掌门弟子，那就更加阻难重重了。他们经过几度悲欢，几番离合，最后一次，白发魔女上武当山找他，武当派的长老囿于宗派之见与门户之念，要把白发魔女驱逐下山，白发魔女性烈如火，动手伤了卓一航一个师叔，卓一航迫于无奈，也出手伤了白发魔女。经过这场大变，卓一航伤心欲绝，几乎发疯，终于辞掉掌门，远赶回疆，追踪白发魔女（他们两人之间的恩恩怨怨，详见拙著《白发魔女传》）。
但卓一航虽经大变，还是颜容未改，白发魔女却不然了，那晚动手之后，心念全灰，一夜之间，头发尽白。她是最爱自己的容貌的，白发之后伤心不已，索性到天山隐居，什么人都不愿见了。
两人就是因这样一再误会，以致后来虽同在天山数十年，却总是避不见面，最后分手时，卓一航曾对她说道：“你为我白了头发，我一定要尽我的力，为你寻找灵丹妙 ，让你恢复青春。”他知道白发魔女最爱自己的容貌，远在他们第一次见面时，白发魔女就说过“红颜易老”话，那时卓一航就开玩笑地对她说过，愿替她找寻头发不白的妙 ，想不到竟成谶语，如今她徐娘未老，竟已白发满头，所以最后分手时，他又旧话重提，又谁料得到这个许诺，竟然成了他数十年来未了的心愿！
此际白发魔女对着两朵优昙花痴痴出神，几十年间事情，电光石火般在心头闪过，她真想不到卓一航对她如此情深，生前一句戏言，死后仍然办到，她睁开眼睛又叹口气道：“这两朵花你还是拿回去吧！“随说随打开锦匣，抽出一张锦笺，只见上面写着一首七律：
“别后音书两不闻，
预知谣琢必纷坛，
只缘海内存知己，
始信天涯若比邻；
历劫了无生死念，
经霜方显做寒心，
冬风尽折花千树，
尚有幽香放上林。”
这首诗正是卓一航当年受她误会之后，托人带给她的。当时她火气正盛，还咀嚼不出其中滋味，如今重读，只觉一片蜜意柔情，显示出他的深心相爱。这首诗首两句是说分别之后不通喜讯，他已预测到一定有很多谣言了；三四两句说，只要彼此真心相爱，只要是知己尚存在世间，那就算人在天涯，也不过如隔墙邻舍一样；五六两句则表示他生死不渝的真情，说是越经过劫难，越经历风霜，相爱的心就越发显现出来；最后两句说纵然劫难像冬风一样，吹折了千树万树爱情的花朵，可是美丽的爱情花朵，仍然是放着不散的幽香！这些话当时读还不觉怎么，现在几十年过去了，卓一航死了，她也满一百岁了，卓一航的诗恰恰做了时间的证人，证明在这几十年间，卓一肮的心事正如他所写的诗一样，一点也没有变。
卓一航和练霓裳退隐江湖,永享神仙眷侣的生活。武当派弟子卓一航，不顾恩怨，与闻名江湖的女侠练霓裳相爱情深，因此遭受同门无情的诬陷。导致练霓裳出走塞外。
痴情的卓一航远赴塞外寻找，皇天不负有心人，卓一航与练霓裳这对苦命鸳鸯终得相见，冰释误会。崇祯受奸臣谗言，杀害抗清大将袁崇焕，致使明朝江山从此瓦解。卓一航与练霓裳对国事失望至极，双双退隐江湖，永享神仙眷侣的生活。
